Genom živoucí fosílie odhalit tajemství extrémní přežití

Ve vývoji některých druhů organismů postupně nahrazena jinou. Mnozí jdou do zapomnění, ale tam jsou ti, kteří jsou relativně málo změn v průběhu celého milion let až po současnost. Taková dlouhověkost je nazýván žijící fosílie, a důvody pro jejich evoluční úspěch s velkou horlivostí vědci se snaží řešit. Jedním z nich je jinan strom - nahosemenných reliktní rostlina, která roste v Číně.

Fossil ginkgo list, což je asi 49.000.000 rok, prakticky nijak neliší od moderního příbuzného.
Foto Ninjatacoshell, CC BY-SA via Wikimedia Commons.

V současné době je rodina gingkovyh, představoval pouze jeden rod, ve kterém je tam jen jeden pohled - Ginkgo biloba (Ginkgo biloba). Zároveň existují zkamenělé vzorky příbuzných druhů, které patří do období permu a datují 270 milionů let. V jeho rozkvětu, a to v polovině Jurassic období, rodina měla asi 15 rodů.

Životaschopnost ginkgo jedinečné. Jeden z nejnápadnějších Dokladem toho je skutečnost, že tyto stromy jsou jedním z mála živočichů, kteří přežili výbuch atomové bomby v japonské město Hirošimu v roce 1945.

Pravděpodobně tytéž vlastnosti jim umožnilo přežít období zalednění v zemské historii, který zničil mnoho dalších druhů rostlin. Navíc, ginkgo vylučují řadu chemických látek na ochranu proti hmyzu, hub a bakterií.

Pokud se chcete dozvědět tajemství přírody, není přímější způsob, než genomu. To je to, co se děje s gingko tým čínských vědců z Pekingu Genomics Institute (BGI), Chzheytszyanskogo University (Zheijiang univerzita) a Čínské akademie věd (CAS).

Úkolem nebylo jednoduché a požadované úsilí mnoha odborníků, jakož i určité technické schopnosti jako genom tohoto jedinečného závodu obsahuje více než 10 miliard párů bází (pro srovnání, lidský genom obsahuje "pouze" než tři miliardy párů bází). Pouze takové množství přijatých surových dat trvalo dva terabajty paměti. Výzkumníci věří, že taková velká velikost může být výsledkem úplné zdvojení genomu rostliny.

Jedním z úžasných vlastností této sekvence byla extrémně vysoké procento opakovaných pozemků - 76,58%, které předtím nebyly pozorovány v žádném z jiných druhů.

Klade důraz na jedinečnost ginkgo a jeho místo v evolučním stromu rostlin. V oficiální tiskové zprávě, studie profesor Zhao Yunpen (Yunpeng Zhao), říká, že ginkgo je jedním z pěti v současné době existujících odděleních semenných rostlin a nemá žádné žijící příbuzné.

Čtení genomu - první krok k popisu všech tajemství přírody. Nyní před vědců je obrovský untilled pole, kde stráví více než jeden rok. Je pravděpodobné, že výsledkem jejich práce bude popisovat unikátní molekulární mechanismy rostlinného přežití, které pomohou, mimo jiné, ke krmení lidstvo v budoucnu.

Článek s prvními výsledky studie zveřejněné v edici GigaScience.